Naruto เป็นการ์ตูนเกี่ยวกับเด็กหนุ่มชื่อ Uzumaki Naruto จากหมู่บ้านนินจาที่รู้จักกันในชื่อ Konoha เขาไม่มีพ่อแม่เพราะว่าตายตั้งแต่เกิดจึงไม่รู้จักความรักของพ่อแม่ เขาเติบโตขึ้นมาคนเดียวในโลกและเขาก็เหงา คนในหมู่บ้านต่างอยู่ห่างจากนารูโตะเพราะพวกเขาได้รับคำสั่งแต่พวกเขาก็กลัวนารูโตะด้วย ภายในนารูโตะถูกผนึกปีศาจจิ้งจอกซึ่งเกือบจะทำลายหมู่บ้านโคโนฮะ เป็นผลให้นารูโตะได้รับการปฏิบัติราวกับว่าเขาเป็นสัตว์ประหลาด ดังนั้น เขารู้ถึงความเจ็บปวดของความเหงา และเพื่อรับมือกับมัน เขาทำเรื่องซุกซนในหมู่บ้านเพื่อเรียกร้องความสนใจจากผู้คน นี่เป็นวิธีของเขาในการหาเหตุผลที่จะมีชีวิตอยู่ นารูโตะมีความฝันที่จะเป็นโฮคาเงะในหมู่บ้าน โฮคาเงะเป็นนินจาที่น่านับถือที่สุดในหมู่บ้าน เหมือนกับประธานาธิบดี เขาต้องการแสดงให้หมู่บ้านเห็นว่าสักวันหนึ่งเขาจะเป็นผู้ยิ่งใหญ่ได้ ดังนั้นเขาจึงเริ่มต้นการเดินทางเพื่อเป็นนินจา
เขามีเพื่อนที่ชื่อซาสึเกะ ซากุระ และคาคาชิ ทั้ง 4 อ่านมังงะ คนจากทีม 7 นินจามักจะรวมกลุ่มกันซึ่งปกติประกอบด้วย 4 คนเมื่อพวกเขาออกไปทำภารกิจที่หมู่บ้าน นี่เป็นวิธีหาเงิน/รายได้ของนินจาโดยการทำภารกิจซึ่งประกอบด้วยระดับต่างๆ ตั้งแต่ F ถึง S ขึ้นอยู่กับความยาก ภารกิจมีความหลากหลายตั้งแต่การค้นหาสัตว์เลี้ยงที่หายไปไปจนถึงการฆ่าเป้าหมาย โคโนฮะเป็นหนึ่งในหมู่บ้านที่ใหญ่ที่สุดในโลกนารูโตะ โลกถูกแบ่งออกเป็นหลายส่วนซึ่งถูกควบคุมโดยหมู่บ้านแต่ละแห่ง พวกเขามักจะเป็นคู่แข่งกันระหว่างหมู่บ้านต่างๆ เพื่อให้ได้มาซึ่งอำนาจและลูกค้ามากขึ้น โลกของนินจาติดอยู่กับห่วงโซ่แห่งความเกลียดชังอยู่เสมอ นี่คือศัตรูที่นารูโตะต้องเผชิญ
มังงะดำเนินไปค่อนข้างไกล นารูโตะอายุ 16 ปีแล้ว และเขาก็ไม่ใช่เด็กเหลือขออีกต่อไป เขามีความเป็นผู้ใหญ่และมีพลังมากขึ้นเมื่อเปรียบเทียบกับตอนที่เขาอายุ 12 ปี แม้ว่าเขาจะยังเป็นยีน (นินจามือใหม่) แต่พลังของเขานั้นเหนือกว่าโจนินมาก (ที่คาดไว้) แต่เขาสูญเสียอุจิวะ ซาสึเกะเพื่อนของเขาไปในความมืด ซาสึเกะออกจากหมู่บ้านโคโนฮะและวางแผนที่จะแก้แค้นด้วยการสังหารชาวบ้านโคโนฮะทั้งหมด นารูโตะที่ไม่มีทางเลือกต้องเผชิญหน้ากับซาสึเกะเพื่อหยุดเขาจากการทำลายโคโนฮะ Naruto และ Sasuke เคยต่อสู้มาก่อนและ Sasuke ชนะเพียงเล็กน้อย นารุโตะยังคงไม่สิ้นหวังที่จะช่วยซาสึเกะเพื่อนของเขาให้พ้นจากความมืดมิด ความพากเพียรของเขาน่าทึ่งมาก แม้ว่าซาสึเกะจะพยายามฆ่าเขา แต่นารูโตะก็ยังต้องการช่วยเขา
